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Enregistrement W1898326375 · doi:10.1034/j.1600-0854.2003.00129.x

Bst‐2/HM1.24 Is a Raft‐Associated Apical Membrane Protein with an Unusual Topology

2003· article· en· W1898326375 sur OpenAlexaff
Sabine Kupzig, Viktor I. Korolchuk, Ruth Rollason, Anna Sugden, Andrew Wilde, George Banting

Notice bibliographique

RevueTraffic · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésCell biologyBiologyTransmembrane proteinLipid raftCell membranePhosphatidylinositolMembrane topologyGolgi apparatusIntegral membrane proteinMembrane proteinTransmembrane domainTopology (electrical circuits)CellMembraneBiochemistrySignal transductionReceptorEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An expression screen of a rat cDNA library for sequences encoding Golgi-localized integral membrane proteins identified a protein with an apparent novel topology, i.e. with both an N-terminal transmembrane domain and a C-terminal glycosyl-phosphatidylinositol (GPI) anchor. Our data are consistent with this. Thus, the protein would have a topology that, in mammalian cells, is shared only by a minor, but pathologically important, topological isoform of the prion protein (PrP). The human orthologue of this protein has been described previously (BST-2 or HM1.24 antigen) as a cell surface molecule that appears to be involved in early pre-B-cell development and which is present at elevated levels at the surface of myeloma cells. We show that rat BST-2/HM1.24 has both a cell surface and an intracellular (juxtanuclear) location and is efficiently internalized from the cell surface. We also show that the cell surface pool of BST-2/HM1.24 is predominantly present in the apical plasma membrane of polarized cells. The fact that rat BST-2/HM1.24 apparently possesses a GPI anchor led us to speculate that it might exist in cholesterol-rich lipid microdomains (lipid rafts) at the plasma membrane. Data from several experiments are consistent with this localization. We present a model in which BST-2/HM1.24 serves to link adjacent lipid rafts within the plasma membrane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations424
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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