Tracing the origins of White Tip disease of <i>Cirsium arvense</i> and its causal agent, <i>Phoma macrostoma</i>
Notice bibliographique
Résumé
Summary Cirsium arvense (Asteraceae) is known as creeping thistle in its native range in the UK and Canada thistle in its invasive North American range. Recently, the fungus Phoma macrostoma was registered in Canada as a bioherbicide in turfgrass, where it causes severe chlorosis (White Tip disease) and death of C. arvense and other broadleaved weeds. It was hypothesised that the disease originated in the UK on its thistle host and, therefore, that fungal isolates from both countries should be biologically and genetically similar. Twenty‐six strains in the genus Phoma– isolated during surveys in the UK – were compared morphologically with the type culture of P. macrostoma, tested for bioherbicidal activity using the inoculum mat bioassay and genetically screened with bioherbicide‐specific primers. White tip disease was found to be restricted to the eastern and southern counties of England. Phoma macrostoma was isolated consistently from diseased bleached tissues. Bioherbicidal isolates of P. macrostoma occupy a unique clade, which is phylogenetically distinct but morphologically indistinguishable from the type culture. Most isolates from the UK had the same bioherbicidal activity and similar genetic make‐up as strain SRC 94‐44B, the active ingredient in the registered Canadian product. The origin of all bioherbicidal strains found to date has a clear presence in both Canada and the UK, with strong genetic similarities, supporting the view of a common ancestry. Thus, on the evidence presented, the ‘white tip’ clade of P. macrostoma evolved in southern England. Therefore, the bioherbicide based on strain SRC 94‐44B should also be eligible for registration in the UK, based on the pest risk assessment data already available.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».