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Enregistrement W1899107772 · doi:10.1111/j.1365-313x.2009.04058.x

The 2-oxoglutarate/malate translocator mediates amino acid and storage protein biosynthesis in pea embryos

2009· article· en· W1899107772 sur OpenAlexaff
Erik Riebeseel, Robert Hausler, Ruslana Radchuk, Tobias Meitzel, Mohammad‐Reza Hajirezaei, R. J. Neil Emery, H. Küster, Adriano Nunes‐Nesi, Alisdair R. Fernie, Winfriede Weschke, Hans Weber

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensTrent University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryBiologyAmino acidPisumPlastidStorage proteinBiosynthesisMalate dehydrogenaseGlutamine synthetaseAmino acid synthesisGlutamineMetabolismChloroplastGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heterotrophic plastids of seeds perform many biosynthetic reactions. Understanding their function in crop plants is crucial for seed production. Physiological functions depend on the uptake of precursors by a range of different metabolite translocators. The 2-oxoglutarate/malate translocator gene (PsOMT), which is highly expressed during pea (Pisum sativum) embryo maturation, has an important role during seed storage. PsOMT functions have been studied by antisense repression in maturing pea embryos, and were found to reduce mRNA levels and transport rates of 2-oxoglutarate and malate by 50-70%. Combined metabolite and transcript profiling revealed that OMT repression affects the conversion of carbohydrates from sucrose into amino acids and proteins, decreases seed weight and delays maturation. OMT-repressed pea embryos have increased levels of organic acids, ammonia, and higher ratios of Asn : Asp and Gln : Glu. Decreased levels of most other amino acids indicate the reduced usage of organic acids and ammonia for amino acid biosynthesis in plastids, possibly caused by substrate limitation of the plastidial glutamine synthetase/glutamine-2-oxoglutarate aminotransferase cycle. Expression of storage proteins is delayed, and mature seeds have reduced protein content. Downregulated gene expression of starch biosynthesis and plastidial glucose-6-phosphate transport in asOMT embryos reveals that decreased 2-oxoglutarate/malate transport capacity affects other pathways of central carbon metabolism. Gene expression analysis related to plastid physiology revealed that OMT repression delays differentiation of storage plastids, thereby maintaining gene expression associated with green chloroplasts. We conclude that OMT is important for protein-storing crop seeds, and is necessary for amino acid biosynthesis in pea seeds. In addition, carbon supply as mediated by OMT controls plastid differentiation during seed maturation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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