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Enregistrement W1902519011

Effect of short-chain fatty acids and pH on aerobic and anaerobic growth of Pseudomonas aeruginosa

2012· article· en· W1902519011 sur OpenAlexaff
Peyman Ghorbani, Prisila Santhakumar, Nades Palaniyar, Hartmut Grasemann

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Chemical Sensor Technologies
Établissements canadiensMcMaster UniversitySickKids Foundation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPropionateButyrateAnaerobic exerciseSputumPseudomonas aeruginosaMicrobiologyBacteriaIncubationFood scienceFermentationMedicineChemistryBiologyBiochemistryPhysiology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Pseudomonas aeruginosa (PA) is one of the most common pathogens in patients with cystic fibrosis (CF) lung disease. PA and other anaerobic bacteria produce short-chain fatty acids (SCFAs) as byproducts of anaerobic fermentation. SCFAs are more volatile at low pH values, and reports have shown that CF patient sputum in acidic. Recently, we detected SCFAs in the low millimolar range in the sputum of CF patients. Aim: To determine if SCFAs affect bacterial growth at different pH levels. Methods: The laboratory strain PAO1 and a clinical isolate PA508 were used for experiments with and without the addition of SCFAs (acetate, propionate, butyrate) at a range of concentrations between 3.125-100 mM and pH values from 5.5-7.0 in tryptic soy broth. Optical density at 600 nm was measured every 30 minutes for a 6 hour period, as well as viable colony counts after the period of incubation. Anaerobic/microaerobic conditions were generated by sealing microplates with optically-clear PCR film. Results: Acetate showed a significant inhibition in growth above 50 mM (>77%, p 20%, p<0.05). Propionate had the highest inhibition, followed by butyrate and acetate. Anaerobic conditions resulted in lower growth overall and showed similar trends in growth inhibition. Results were consistent for both PA strains tested. Conclusion: SCFAs increase the growth of laboratory and clinical strains of PA at concentrations found in CF patient sputum, but inhibit growth at high concentrations. SCFAs produced by anaerobic bacteria may provide an indication of increased virulence of PA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,558

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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