<i>PpYUC11</i>, a strong candidate gene for the stony hard phenotype in peach (<i>Prunus persica</i>L. Batsch), participates in IAA biosynthesis during fruit ripening
Notice bibliographique
Résumé
High concentrations of indole-3-acetic acid (IAA) are required for climacteric ethylene biosynthesis to cause fruit softening in melting flesh peaches at the late ripening stage. By contrast, the fruits of stony hard peach cultivars do not soften and produce little ethylene due to the low IAA concentrations. To investigate the regulation of IAA accumulation during peach ripening [the transition from stage S3 to stage S4 III (climacteric)], a digital gene expression (DGE) analysis was performed. The expression patterns of auxin-homeostasis-related genes were compared in fruits of the melting flesh peach 'Goldhoney 3' and the stony hard flesh peach 'Yumyeong' during the ripening stage. It is revealed here that a YUCCA flavin mono-oxygenase gene (PpYUC11, ppa008176m), a key gene in auxin biosynthesis, displayed an identical differential expression profile to the profiles of IAA accumulation and PpACS1 transcription: the mRNA transcripts increased at the late ripening stage in melting flesh peaches but were below the limit of detection in mature fruits of stony hard peaches. In addition, the strong association between intron TC microsatellite genotypes of PpYUC11 and the flesh texture (normal or stony hard) is described in 43 peach varieties, indicating that this locus may be responsible for the stony hard phenotype in peach. These findings support the hypothesis that PpYUC11 may play an essential role in auxin biosynthesis during peach fruit ripening and is a candidate gene for the control of the stony hard phenotype in peach.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».