Analysis of the regulatory motifs in eukaryotic initiation factor 4E‐binding protein 1
Notice bibliographique
Résumé
Mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1) phosphorylates proteins such as eukaryotic initiation factor 4E-binding protein 1 (4E-BP1) and the S6 kinases. These substrates contain short sequences, termed TOR signalling (TOS) motifs, which interact with the mTORC1 component raptor. Phosphorylation of 4E-BP1 requires an additional feature, termed the RAIP motif (Arg-Ala-Ile-Pro). We have analysed the interaction of 4E-BP1 with raptor and the amino acid residues required for functional RAIP and TOS motifs, as assessed by raptor binding and the phosphorylation of 4E-BP1 in human cells. Binding of 4E-BP1 to raptor strongly depends on an intact TOS motif, but the RAIP motif and additional C-terminal features of 4E-BP1 also contribute to this interaction. Mutational analysis of 4E-BP1 reveals that isoleucine is a key feature of the RAIP motif, that proline is also very important and that there is greater tolerance for substitution of the first two residues. Within the TOS motif, the first position (phenylalanine in the known motifs) is most critical, whereas a wider range of residues function in other positions (although an uncharged aliphatic residue is preferred at position three). These data provide important information on the structural requirements for efficient signalling downstream of mTORC1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».