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Enregistrement W1904671705 · doi:10.1111/tpj.13017

<scp>RECA</scp> plays a dual role in the maintenance of chloroplast genome stability in <i>Physcomitrella patens</i>

2015· article· en· W1904671705 sur OpenAlexaff
Masaki Odahara, Takayuki Inouye, Yoshiki Nishimura, Yasuhiko Sekine

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensSaint Paul University
Organismes subventionnairesMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésPhyscomitrella patensChloroplast DNAHomologous recombinationBiologyGeneticsGenomeChloroplastDNA repairMutantMethyl methanesulfonateInverted repeatGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chloroplast DNA (cpDNA) encodes essential genes for chloroplast functions, including photosynthesis. Homologous recombination occurs frequently in cpDNA; however, its significance and underlying mechanism remain poorly understood. In this study, we analyzed the role of a nuclear-encoded chloroplast-localized homolog of RecA recombinase, which is a key factor in homologous recombination in bacteria, in the moss Physcomitrella patens. Complete knockout (KO) of the P. patens chloroplast RecA homolog RECA2 caused a modest growth defect and conferred sensitivity to methyl methanesulfonate and UV. The KO mutant exhibited low recovery of cpDNA from methyl methanesulfonate damage, suggesting that RECA2 knockout impairs repair of damaged cpDNA. The RECA2 KO mutant also exhibited reduced cpDNA copy number and an elevated level of cpDNA molecule resulting from aberrant recombination between short dispersed repeats (13-63 bp), indicating that the RECA2 KO chloroplast genome was destabilized. Taken together, these data suggest a dual role for RECA2 in the maintenance of chloroplast genome stability: RECA2 suppresses aberrant recombination between short dispersed repeats and promotes repair of damaged DNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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