Using the Generic Synteny Browser (GBrowse_syn)
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Genome Browsers are software that allow the user to view genome annotations in the context of a reference sequence, such as a chromosome, contig, scaffold, etc. The Generic Genome Browser (GBrowse) is an open-source genome browser package developed as part of the Generic Model Database Project (see UNIT ; Stein et al., 2002). The increasing number of sequenced genomes has led to a corresponding growth in the field of comparative genomics, which requires methods to view and compare multiple genomes. Using the same software framework as GBrowse, the Generic Synteny Browser (GBrowse_syn) allows the comparison of colinear regions of multiple genomes using the familiar GBrowse-style Web page. Like GBrowse, GBrowse_syn can be configured to display any organism, and is currently the synteny browser used for model organisms such as C. elegans (WormBase; http://www.wormbase.org; see UNIT 1.8) and Arabidopsis (TAIR; http://www.arabidopsis.org; see UNIT 1.1). GBrowse_syn is part of the GBrowse software package and can be downloaded from the Web and run on any Unix-like operating system, such as Linux, Solaris, or MacOS X. GBrowse_syn is still under active development. This unit will cover installation and configuration as part of the current stable version of GBrowse (v. 1.71).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle