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Enregistrement W1905147122 · doi:10.1111/j.1537-2995.2011.03530.x

Evaluation of the sterility testing process of hematopoietic stem cells at Canadian Blood Services

2012· article· en· W1905147122 sur OpenAlexafffundabout
Cherie Mastronardi, Yang Lin, Mike Halpenny, Baldwin Toye, Sandra Ramírez‐Arcos

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensCanadian Blood Services
Organismes subventionnairesIndustry CanadaCanadian Blood Services
Mots-clésHaematopoiesisSterilityStem cellMedicineProcess (computing)Blood testingBiologyInternal medicineComputer scienceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Sterility testing of hematopoietic stem cells (HSCs) at The Canadian Blood Services Stem Cell Laboratory is performed using BacT/ALERT aerobic (SA) culture bottles. This study was conducted to verify the efficacy of this method and to assess the use of the BacT/ALERT aerobic (BPA) and anaerobic (BPN) culture bottles for microbial testing of HSCs. STUDY DESIGN AND METHODS: HSC products, including cryopreserved apheresis peripheral blood, marrow, and cord blood and fresh cord blood, were spiked with four aerobic organisms including Staphylococcus epidermidis, Bacillus cereus, Pseudomonas aeruginosa, and Candida albicans, and the anaerobe Bacteroides fragilis at a target concentration of 100 colony-forming units (CFUs)/mL. One to 2 mL of pre- and postspiked samples was inoculated into SA, BPA, and BPN bottles in duplicate and incubated for 5 to 10 days. The presence of the testing organisms in positive culture bottles was confirmed by plating on blood agar. RESULTS: The BacT/ALERT system detected the aerobic organisms in all HSCs in SA and BPA bottles within 34.1 hours while B. fragilis was detected only in BPN bottles within 68.6 hours. The mean recovered concentration of microorganisms in the HSC products ranged from 55 to 352 CFUs/mL with the exception of B. cereus, which was greater than 10(3) CFUs/mL. CONCLUSION: This study shows that the current sterility testing process at the Canadian Blood Services Stem Cell Laboratory detected the tested aerobic but not the anaerobic microbial contaminants in HSCs. The ability of the BacT/ALERT system using BPA and BPN bottles to detect bacterial contamination in HSCs was also demonstrated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,454
Score d'incertitude au seuil0,902

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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