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Enregistrement W1906091842 · doi:10.1111/j.1095-8312.2011.01661.x

A cryptic contact zone between divergent mitochondrial DNA lineages in southwestern North America supports past introgressive hybridization in the yellow-rumped warbler complex (Aves: Dendroica coronata)

2011· article· en· W1906091842 sur OpenAlexafffund
Borja Milá, David P. L. Toews, Thomas B. Smith, Robert K. Wayne

Notice bibliographique

RevueBiological Journal of the Linnean Society · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaU.S. Environmental Protection AgencyNational Science Foundation
Mots-clésBiologyWarblerIntrogressionLineage (genetic)Species complexMonophylyMitochondrial DNAEvolutionary biologyPhylogeographyGene flowReproductive isolationZoologyPopulationCladeEcologyPhylogenetic treeGenetic variationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Using genetic data to study the process of population divergence is central to understanding speciation, yet distinguishing between recent divergence and introgressive hybridization is challenging. In a previous study on the phylogeography of the yellow-rumped warbler complex using mitochondrial (mt)DNA data, we reported limited sequence divergence and a lack of reciprocal monophyly between myrtle and Audubon's warblers (Dendroica coronata and Dendroica auduboni, respectively), suggesting very recent isolation. In the present study, we report the results obtained from a subsequent sampling of Audubon's warbler in Arizona and Utah (‘memorabilis’ race), which shows that, although this taxon is similar to auduboni in plumage colour, most memorabilis individuals sampled (93%) carry haplotypes that belong to the divergent black-fronted warbler lineage (Dendroica nigrifrons) of Mexico. Furthermore, the auduboni and nigrifrons lineages mix in southern Utah at a narrow, yet apparently ‘cryptic’ contact zone. Newly-available evidence from nuclear markers indicating marked differentiation between auduboni and coronata has focused attention on the possibility of mtDNA introgression in the absence of nuclear gene flow, and the results of the present study are consistent with the hypothesis that the mtDNA of auduboni was indeed historically introgressed from the coronata lineage. Analysis of morphological traits shows that memorabilis is significantly differentiated from auduboni and nigrifrons in some traits, yet is overall intermediate between the two, which is consistent with a shared common ancestor for the auduboni/memorabilis/nigrifrons group. The striking, unexpected mtDNA pattern reported in the present study reveals a complex evolutionary history of the yellow-rumped warbler complex, and cautions against the exclusive use of mtDNA to infer evolutionary relationships.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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