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Enregistrement W190626844 · doi:10.1074/jbc.m704870200

Regulation of IRF-3-dependent Innate Immunity by the Papain-like Protease Domain of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus

2007· article· en· W190626844 sur OpenAlexaff
Santhana G. Devaraj, Nan Wang, Zhongbin Chen, Zihong Chen, Monica Tseng, Naina Barretto, Rongtuan Lin, C. J. Peters, Chien‐Te K. Tseng, Susan C. Baker, Kui Li

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute on Drug Abuse
Mots-clésInnate immune systemCoronavirusImmunityRespiratory systemProteaseMedicineVirologyPapainCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ImmunologyBiologyImmune systemInternal medicineEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) is a novel coronavirus that causes a highly contagious respiratory disease, SARS, with significant mortality. Although factors contributing to the highly pathogenic nature of SARS-CoV remain poorly understood, it has been reported that SARS-CoV infection does not induce type I interferons (IFNs) in cell culture. However, it is uncertain whether SARS-CoV evades host detection or has evolved mechanisms to counteract innate host defenses. We show here that infection of SARS-CoV triggers a weak IFN response in cultured human lung/bronchial epithelial cells without inducing the phosphorylation of IFN-regulatory factor 3 (IRF-3), a latent cellular transcription factor that is pivotal for type I IFN synthesis. Furthermore, SARS-CoV infection blocked the induction of IFN antiviral activity and the up-regulation of protein expression of a subset of IFN-stimulated genes triggered by double-stranded RNA or an unrelated paramyxovirus. In searching for a SARS-CoV protein capable of counteracting innate immunity, we identified the papain-like protease (PLpro) domain as a potent IFN antagonist. The inhibition of the IFN response does not require the protease activity of PLpro. Rather, PLpro interacts with IRF-3 and inhibits the phosphorylation and nuclear translocation of IRF-3, thereby disrupting the activation of type I IFN responses through either Toll-like receptor 3 or retinoic acid-inducible gene I/melanoma differentiation-associated gene 5 pathways. Our data suggest that regulation of IRF-3-dependent innate antiviral defenses by PLpro may contribute to the establishment of SARS-CoV infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations420
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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