Small Heat Shock Proteins Produced by <i>Pseudomonas Aeruginosa</i> Clonal Variants Isolated from Diverse Niches
Notice bibliographique
Résumé
Genomic islands interspersed in the chromosome of P. aeruginosa led to inter- and intraclonal diversity. Recently, a particular clone of P. aeruginosa called clone C was isolated from cystic fibrosis (CF) patients, clinical and non-clinical habitats throughout Europe and in Canada. P. aeruginosa clone C strains harbour up to several hundred acquired genes involved in the adaptation of bacteria to diverse niches. Two genes ( hp25 and hp18) from one of the hypervariable regions in the chromosome of clone C strains were highly expressed under standard culture conditions as well as under conditions that mimicked CF sputum environment. Protein sequence analysis revealed that Hp25 and Hp18 belonged to small heat shock protein (sHSP) family. Hp25 protein possessed α-crystallin domain, which is a conserved region among heat shock proteins involved in diverse functions. Sequence homology search revealed that in the Methylobacillus flagellatus genome both genes were situated close to each other and the hp25 gene is found among a few other members of Proteobacteria. Expression of hp25 and hp18 by inter- and intraclonal strains of P. aeruginosa suggested that both genes were present in the stable part of the hypervariable region at the toxR locus and might play a role in their adaptation to diverse niches including the CF lung environment.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».