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Enregistrement W1908191708 · doi:10.1002/humu.22843

Matching Two Independent Cohorts Validates<i>DPH1</i>as a Gene Responsible for Autosomal Recessive Intellectual Disability with Short Stature, Craniofacial, and Ectodermal Anomalies

2015· article· en· W1908191708 sur OpenAlexafffund
Catrina M. Loucks, Jillian S. Parboosingh, Ranad Shaheen, François P. Bernier, D. Ross McLeod, Mohammed Zain Seidahmed, Erik G. Puffenberger, Carole Ober, Robert A. Hegele, Kym M. Boycott, Fowzan S. Alkuraya, A. Micheil Innes

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioWestern UniversityAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyShort statureCraniofacialGeneticsGeneIntellectual disabilityEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recently, Alazami et al. (2015) identified 33 putative candidate disease genes for neurogenetic disorders. One such gene was DPH1, in which a homozygous missense mutation was associated with a 3C syndrome-like phenotype in four patients from a single extended family. Here, we report a second homozygous missense variant in DPH1, seen in four members of a founder population, and associated with a phenotype initially reminiscent of Sensenbrenner syndrome. This postpublication "match" validates DPH1 as a gene underlying syndromic intellectual disability with short stature and craniofacial and ectodermal anomalies, reminiscent of, but distinct from, 3C and Sensenbrenner syndromes. This validation took several years after the independent discoveries due to the absence of effective methods for sharing both candidate phenotype and genotype data between investigators. Sharing of data via Web-based anonymous data exchange servers will play an increasingly important role toward more efficient identification of the molecular basis for rare Mendelian disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,158
Score d'incertitude au seuil0,706

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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