Identification of a regulatory region which controls inducible expression of the human CD200 gene (35.36)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract CD200 is a type I membrane glycoprotein and plays an important role in prevention of graft rejection, autoimmune diseases and spontaneous abortion by delivering an immunoregulatory signal through interaction with its receptor. The expression of CD200 is not only constitutive but also inducible. We previously documented evidence for C/EBPβ as being important in regulation of constitutive expression of CD200. However, the molecular mechanism(s) controlling inducible expression of CD200 are yet to be defined. Our current studies showed that the expression of CD200 was induced by ConA, IFN-γ and/or TNF-α. To investigate the potential regulatory regions responsible for inducible expression of CD200, a DNase I hypersensitivity assay was performed in Jurkat cells. A prominent hypersensitivity site was detected after stimulation and localized in the region ~ 5.6 kb upstream of the transcriptional start site. Four cis elements were identified in this region: one for NF-κB binding, one IFN-γ activation site (GAS) and two IRF binding sites. To test whether those cis elements play a critical role for inducible expression of CD200, the potential regulatory region was cloned upstream of the CD200 core promoter. Mutation of the binding site for NF-κB, GAS or the first IRF resulted in abolition of the activity of this region, whereas mutation of the second IRF had no effect. A ChIP assay was performed confirming this result.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».