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Enregistrement W191086023 · doi:10.4049/jimmunol.186.supp.64.4

Notch signaling requires GATA-3 for the survival of cells entering the T-lineage development program (64.4)

2011· article· en· W191086023 sur OpenAlexaff
Patrycja Thompson, Renée de Pooter, Juan Carlos Zúñiga‐Pflücker

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensSunnybrook HospitalUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNotch signaling pathwayBiologyProgenitor cellCell biologyLineage (genetic)LymphopoiesisCell cycleBone marrowCellSignal transductionGeneCancer researchStem cellImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract GATA-3 plays a crucial role in T cell development, however its role and collaboration with the Notch signaling pathway in the induction of T cell specification and commitment have not been fully elucidated. Work in our laboratory using both, in vitro and in vivo models of T cell development, has shown that GATA-3 deficiency arrests this development at the DN2 stage but does not result in B-lymphopoiesis in the presence of Notch ligand Delta-like 1 (Dll1). These GATA-3-/- progenitors express T-lineage associated genes but are unable to survive the T-specification event as indicated by their increased rate of apoptosis. Cell cycle regulation genes, mainly p19Arf and p16Ink4a (Arf/Ink), are upregulated in these cells as indicated by gene expression microarray and qRT-PCR analyses. We have thus sought to address the possibility that GATA-3 represses Arf/Ink following T cell specification/commitment in the presence of Notch signals. We are employing ChIP assay to show whether potential GATA-3 recognition sequences present in the Arf/Ink promoter region are occupied and regulated by GATA-3. Finally, using GATA-3-/-Arf-Ink-/- bone marrow progenitors, we will address a possible rescue of the early T cell developmental block observed in the absence of GATA-3. These experiments will help to identify a potential mechanism of how GATA-3 and the Notch signaling pathway collaborate in regulating T-lineage specification, commitment and survival during T cell development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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Résumé présentoui

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