Notch signaling requires GATA-3 for the survival of cells entering the T-lineage development program (64.4)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract GATA-3 plays a crucial role in T cell development, however its role and collaboration with the Notch signaling pathway in the induction of T cell specification and commitment have not been fully elucidated. Work in our laboratory using both, in vitro and in vivo models of T cell development, has shown that GATA-3 deficiency arrests this development at the DN2 stage but does not result in B-lymphopoiesis in the presence of Notch ligand Delta-like 1 (Dll1). These GATA-3-/- progenitors express T-lineage associated genes but are unable to survive the T-specification event as indicated by their increased rate of apoptosis. Cell cycle regulation genes, mainly p19Arf and p16Ink4a (Arf/Ink), are upregulated in these cells as indicated by gene expression microarray and qRT-PCR analyses. We have thus sought to address the possibility that GATA-3 represses Arf/Ink following T cell specification/commitment in the presence of Notch signals. We are employing ChIP assay to show whether potential GATA-3 recognition sequences present in the Arf/Ink promoter region are occupied and regulated by GATA-3. Finally, using GATA-3-/-Arf-Ink-/- bone marrow progenitors, we will address a possible rescue of the early T cell developmental block observed in the absence of GATA-3. These experiments will help to identify a potential mechanism of how GATA-3 and the Notch signaling pathway collaborate in regulating T-lineage specification, commitment and survival during T cell development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».