Detection of genomic deletions of <i><scp>PKP2</scp></i> in arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy
Notice bibliographique
Résumé
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) is an inherited myocardial disease that predominantly affects the right ventricle and is associated with ventricular arrhythmias that may lead to sudden cardiac death. Mutations within at least seven separate genes have been identified to cause ARVC, however a genetic culprit remains elusive in approximately 50% of cases. Although negative genetic testing may be secondary to pathogenic mutations within undiscovered genes, an alternative explanation may be the presence of large deletions or duplications involving known genes. These large copy number variants may not be detected with standard clinical genetic testing which is presently limited to direct DNA sequencing. We describe two cases of ARVC possessing large deletions involving plakophilin-2 (PKP2) identified with microarray analysis and/or multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) that would have been classified as genotype negative with standard clinical genetic testing. A deletion of the entire coding region of PKP2 excluding exon 1 was identified in patient 1 and his son. In patient 2, MLPA analysis of PKP2 revealed deletion of the entire gene with subsequent microarray analysis demonstrating a de novo 7.9 Mb deletion of chromosome 12p12.1p11.1. These findings support screening for large copy number variants in clinically suspected ARVC cases without clear disease causing mutations following initial sequencing analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».