Potential and limitations of bovine-specific arrays for the analysis of mRNA levels in early development: preliminary analysis using a bovine embryonic array
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
New insights into the early development of large mammals are becoming available through the measurement of differential mRNA levels in oocytes and preimplantation embryos. These advances in knowledge are rapidly picking up in pace, mainly owing to the advantages brought by new molecular biology approaches being developed. The possibility of amplifying the starting material and therefore making measurements in single embryo units is now feasible. With these tools, the evaluation of variations in gene expression patterns during the preimplantation period or the impact of culture on mRNA levels is now possible. However, it is important to keep in mind that these methods still have limitations associated with sample preparation or the use of the appropriate controls. Even proper methods of analysis are very important to achieve the full benefit of the application of these tools. The present paper describes some of the potential, as well as limitations, of mRNA level analysis in early embryos, especially for microarray analysis. We have generated a bovine cDNA array (>2000 clones) that contains expressed sequence tags (ESTs) collected from various preimplantation development stages. Using this chip, we have initiated the characterisation of global mRNA level patterns of several key developmental stages from the immature oocyte to the blastocyst stage. As expected, the hybridisation results indicate very different expression profiles involving hundreds of genes when comparing oocyte and blastocyst samples to a reference mRNA sample made from a pool of ESTs from pooled somatic tissues. Although this array is still in its preliminary stage and the EST bank has not been processed to contain only unigenes, it is already a very useful tool for discovering candidate genes that may play important roles during early embryonic life.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle