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Enregistrement W1918003350 · doi:10.1093/genetics/163.3.895

Multiple Translational Control Sequences in the 5′ Leader of the Chloroplast <i>psbC</i> mRNA Interact With Nuclear Gene Products in <i>Chlamydomonas reinhardtii</i>

2003· article· en· W1918003350 sur OpenAlexaff
William Zerges, Andrea H Auchincloss, Jean‐David Rochaix

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChlamydomonas reinhardtiiBiologyMutantGeneticsGeneChlamydomonasTranslation (biology)Eukaryotic translationUntranslated regionNuclear geneReporter geneChloroplastMessenger RNAGene expressionFive prime untranslated regionWild typeGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translation of the chloroplast psbC mRNA in the unicellular eukaryotic alga Chlamydomonas reinhardtii is controlled by interactions between its 547-base 5' untranslated region and the products of the nuclear loci TBC1, TBC2, and possibly TBC3. In this study, a series of site-directed mutations in this region was generated and the ability of these constructs to drive expression of a reporter gene was assayed in chloroplast transformants that are wild type or mutant at these nuclear loci. Two regions located in the middle of the 5' leader and near the initiation codon are important for translation. Other deletions still allow for partial expression of the reporter gene in the wild-type background. Regions with target sites for TBC1 and TBC2 were identified by estimating the residual translation activity in the respective mutant backgrounds. TBC1 targets include mostly the central part of the leader and the translation initiation region whereas the only detected TBC2 targets are in the 3' part. The 5'-most 93 nt of the leader are required for wild-type levels of transcription and/or mRNA stabilization. The results indicate that TBC1 and TBC2 function independently and further support the possibility that TBC1 acts together with TBC3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,368

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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