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Enregistrement W1918077062

Understanding the role of the Vid30c in the nutrient-dependent turnover of hexose transporters in Saccharomyces cerevisiae

2012· dissertation· en· W1918077062 sur OpenAlexfundno aff
Christopher Snowdon

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsGenome Canada
Mots-clésHexoseSaccharomyces cerevisiaeTransporterNutrientBiochemistryChemistryFood scienceYeastGeneEnzymeOrganic chemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Saccharomyces cerevisiae is confronted with continually changing and diverse nutrient conditions. As such, it has adapted to utilize both a wide variety of nutrient sources and to preferentially use the most nutrient-rich source to obtain a competitive advantage. The transcription, intracellular trafficking and protein turnover of nutrient transporters, including the hexose transporter proteins (Hxts), are strictly regulated in response to nutrient conditions. The low affinity hexose transporter Hxt3p is highly expressed and localizes to the plasma membrane during growth in abundant glucose where it plays a major role in the transport of this sugar. However, following a shift to ethanol as a sole carbon source, Hxt3p is endocytosed and targeted to the vacuole for degradation while its expression is also repressed. In contrast, the high affinity hexose transporter Hxt7p is actively expressed and functional in the plasma membrane when glucose is limiting and nitrogen is abundant. Upon nitrogen starvation or rapamycin treatment, HXT7 transcription decreases and the protein is targeted for degradation. The mechanisms that govern these regulatory steps are poorly understood. The Vid and Gid proteins, several of which compose the Vid30 complex (Vid30c), facilitate the nutrient-dependent degradation of the gluconeogenic enzymes FBPase and Mdh2p when glucose-starved cells are replenished with glucose. Here we show that components of the Vid30c are needed for the ethanol-induced turnover of Hxt3p and the rapamycin or nitrogen starvation-induced degradation of Hxt7p. In addition, we demonstrate that the signals for the ethanol-induced turnover of Hxt3p and the rapamycin-induced turnover of Hxt7p converge on the Vid30c upstream of the Ras/cAMP/PKA pathway, ultimately controlling the degradation of both these hexose transporters. Finally, we provide evidence that the Vid30c controls the localization of the Ras GEF Cdc25p and may therefore directly regulate the activity of the Ras/cAMP/PKA pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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