<i>Acinetobacter baylyi</i>long-term stationary-phase protein StiP is a protease required for normal cell morphology and resistance to tellurite
Notice bibliographique
Résumé
We investigated the Acinetobacter baylyi gene ACIAD1960, known from previous work to be expressed during long-term stationary phase. The protein encoded by this gene had been annotated as a Conserved Hypothetical Protein, surrounded by putative tellurite resistance ("Ter") proteins. Sequence analysis suggested that the protein belongs to the DUF1796 putative papain-like protease family. Here, we show that the purified protein, subsequently named StiP, has cysteine protease activity. Deletion of stiP causes hypersensitivity to tellurite, altered population dynamics during long-term batch culture, and most strikingly, dramatic alteration of normal cell morphology. StiP and associated Ter proteins (the StiP-Ter cluster) are therefore important for regulating cell morphology, likely in response to oxidative damage or depletion of intracellular thiol pools, triggered artificially by tellurite exposure. Our finding has broad significance because while tellurite is an extremely rare compound in nature, oxidative damage, the need to maintain a particular balance of intracellular thiols, and the need to regulate cell morphology are ubiquitous.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».