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Enregistrement W1919247819 · doi:10.1016/j.clpt.2005.12.124

OV-A-3Genetic determinants of the hepatic expression of the phase II conjugating UGT1A3 enzyme

2006· article· en· W1919247819 sur OpenAlexaff
Bertrand Caillier, Laurent Villeneuve, Olivier Barbier, Chantal Guillemette

Notice bibliographique

RevueClinical Pharmacology & Therapeutics · 2006
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEnzymeChemistryPhase (matter)BiochemistryPharmacologyMedicineOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/AIMS UDP-glucuronosyltransferase UGT1A3 is significant for the glucuronic acid conjugation of a diversity of endo- and xenobiotics in the liver. Considering the variability in UGT1A3-mediated hepatic glucuronidation activity, this study was designed to identify common UGT1A3 genetic variants and determine their potential for contributing to interindividual differences. METHODS Single nucleotide polymorphism (SNP) discovery was accomplished by resequencing DNA samples from healthy Caucasians. Haplotypes were inferred and population frequencies estimated using PHASE version 2.1. For functional analysis, we used HepG2 cells in transfection studies with UGT1A3/luciferase constructs and electromobility shift assays. RESULTS Sequence analysis revealed six UGT1A3 upstream SNPs and 4 common (3–26%) promoter region haplotypes were inferred. One of the promoter variants fell within a putative binding factor site for the hepatocyte nuclear factor (HNF)-1α at −148 and is associated with a significant decrease in luciferase activity. The −148 T>C variant significantly decreased by 50% the binding of the protein complex while the HNF1α-specific antibody was able to supershift entirely the DNA-protein complex. CONCLUSION UGT1A3 common promoter haplotype variants modulate gene function, namely through a reduction of the HNF1α-mediated promoter activation, and might contribute to interindividual differences in UGT1A3-mediated glucuronidation. Clinical Pharmacology & Therapeutics (2005) 79, P35–P35; doi: 10.1016/j.clpt.2005.12.124

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,164
Tête enseignante GPT0,503
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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