OV-A-3Genetic determinants of the hepatic expression of the phase II conjugating UGT1A3 enzyme
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND/AIMS UDP-glucuronosyltransferase UGT1A3 is significant for the glucuronic acid conjugation of a diversity of endo- and xenobiotics in the liver. Considering the variability in UGT1A3-mediated hepatic glucuronidation activity, this study was designed to identify common UGT1A3 genetic variants and determine their potential for contributing to interindividual differences. METHODS Single nucleotide polymorphism (SNP) discovery was accomplished by resequencing DNA samples from healthy Caucasians. Haplotypes were inferred and population frequencies estimated using PHASE version 2.1. For functional analysis, we used HepG2 cells in transfection studies with UGT1A3/luciferase constructs and electromobility shift assays. RESULTS Sequence analysis revealed six UGT1A3 upstream SNPs and 4 common (3–26%) promoter region haplotypes were inferred. One of the promoter variants fell within a putative binding factor site for the hepatocyte nuclear factor (HNF)-1α at −148 and is associated with a significant decrease in luciferase activity. The −148 T>C variant significantly decreased by 50% the binding of the protein complex while the HNF1α-specific antibody was able to supershift entirely the DNA-protein complex. CONCLUSION UGT1A3 common promoter haplotype variants modulate gene function, namely through a reduction of the HNF1α-mediated promoter activation, and might contribute to interindividual differences in UGT1A3-mediated glucuronidation. Clinical Pharmacology & Therapeutics (2005) 79, P35–P35; doi: 10.1016/j.clpt.2005.12.124
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».