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Enregistrement W1919411545 · doi:10.1111/j.1742-4658.2010.07995.x

Lipins from plants are phosphatidate phosphatases that restore lipid synthesis in a <i>pah1Δ</i> mutant strain of <i>Saccharomyces cerevisiae</i>

2010· article· en· W1919411545 sur OpenAlexafffund
Elzbieta Mietkiewska, Rodrigo M.P. Siloto, Jay Dewald, Saleh Shah, David N. Brindley, Randall J. Weselake

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensAlberta InnovatesUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta InnovatesAlberta Innovates Bio SolutionsFondation pour la Recherche MédicaleCanada Research ChairsUniversity of Alberta
Mots-clésArabidopsisPhosphatidateBiochemistryMutantBiologySaccharomyces cerevisiaeGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The identification of the yeast phosphatidate phosphohydrolase (PAH1) gene encoding an enzyme with phosphatidate phosphatase (PAP; 3-sn-phosphatidate phosphohydrolase, EC 3.1.3.4) activity led to the discovery of mammalian Lipins and subsequently to homologous genes from plants. In the present study, we describe the functional characterization of Arabidopsis and Brassica napus homologs of PAH1. Recombinant expression studies confirmed that homologous PAHs from plants can rescue different phenotypes exhibited by the yeast pah1Δ strain, such as temperature growth sensitivity and atypical neutral lipid composition. Using this expression system, we examined the role of the putative catalytic motif DXDXT and other conserved residues by mutational analysis. Mutants within the carboxy-terminal lipin domain displayed significantly decreased PAP activity, which was reflected by their limited ability to complement different phenotypes of pah1Δ. Subcellular localization studies using a green fluorescent protein fusion protein showed that Arabidopsis PAH1 is mostly present in the cytoplasm of yeast cells. However, upon oleic acid stimulation, green fluorescent protein fluorescence was predominantly found in the nucleus, suggesting that plant PAH1 might be involved in the transcriptional regulation of gene expression. In addition, we demonstrate that mutation of conserved residues that are essential for the PAP activity of the Arabidopsis PAH1 enzyme did not impair its nuclear localization in response to oleic acid. In conclusion, the present study provides evidence that Arabidopsis and B. napus PAHs restore lipid synthesis in yeast and that DXDXT is a functional enzymic motif within plant PAHs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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