Assessment of Two Alternative Sample Transport and Fixation Methods in the Microbiological Diagnosis of Bacterial Vaginosis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The standard method for specimen collection and transport for microbiological diagnosis of bacterial vaginosis is an air-dried smear of vaginal secretions, promptly heat- or alcohol-fixed, Gram-stained and scored by Nugent's criteria. OBJECTIVE: TWO ALTERNATIVE METHODS ARE EVALUATED: sending a swab in transport medium to be smeared and Gram-stained in the laboratory two days later; and sending a smear of vaginal secretions sprayed with cytological fixative to the laboratory for Gram staining seven days later. METHODS: One hundred fifty-two women aged 18 years and older who attended a hospital colposcopy clinic or a community healthy sexuality clinic were studied. This was a prospective study: three vaginal swabs were taken from each patient and handled as described above. Each slide was blindly and independently interpreted by two microbiology technologists. The sensitivity, specificity and coefficient of agreement of the transported swab and cytologically fixed methods were compared with the air-dried smear method. RESULTS: Smears from swabs in transport medium and cytologically fixed smears both had 90% sensitivity and 97% specificity for bacterial vaginosis compared with diagnosis from air-dried smears. Cohen's kappa was 0.88 (95% CI 0.79 to 0.97) for each method. Inter-rater reliability assessed over all slides (all sampling techniques) was excellent (kappa 0.94). CONCLUSIONS: For the diagnosis of bacterial vaginosis, both alternative techniques provide results equivalent to air-dried direct smears. A vaginal smear sprayed with cytological fixative provides immediate fixation of material to the slide, permits delays in swab transport and avoids the requirement for transport at a controlled temperature imposed by swabs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,050 | 0,105 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».