Transmission dynamics and risk factors for pandemic H1N1‐related illness: outbreak investigation in a rural community of British Columbia, Canada
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To characterize the first-wave epidemiologic features of influenza-like illness (ILI) associated with the novel pandemic A/H1N1 [A(H1N1)pdm09] virus. METHODS: We used generalized linear mixed models (GLMM) to assess risk factors and non-parametric and/or parametric distributions to estimate attack rates, secondary attack rates (SAR), duration of illness, and serial interval during a laboratory-confirmed community outbreak of A(H1N1)pdm09 clustered around on-reserve residents and households of an elementary school in rural British Columbia, Canada, in late April/early May 2009. ILI details were collected as part of outbreak investigation by community telephone survey in early June 2009. RESULTS: Overall, 92/408 (23%) of participants developed ILI and 36/408 (9%) experienced medically attended ILI (MAILI). The overall SAR in households was 22%: highest among participants 1-4 years of age (yoa) (50%) followed by < 1 yoa (38%), 5-8 yoa (20%), 10-19 yoa (13%), 20-49 yoa (20%), and 50-64 yoa (0%). The median serial interval was estimated at 3·5 days (95% CI: 2·1-5·1). In multivariable GLMM analysis, having a chronic condition (OR: 2·58; 95% CI: 1·1-6·04), younger age [1-8 yoa: OR: 4·63; 95% CI: 2·25-9·52; 9-19 yoa: OR: 1·95; 95% CI: 0·97-3·9 (referent: ≥ 20 yoa)] and receipt of 2008-2009 influenza vaccine (OR: 2·68; 95% CI: 1·37-5·25) were associated with increased risk of ILI. Median duration of illness was 9 days, longer among those with chronic conditions (21 days). Median time to seeking care after developing illness was 4·5 days. On-reserve participants had higher chronic conditions, household density, ILI, MAILI, and SAR. CONCLUSIONS: During a community outbreak of A(H1N1)pdm09-related illness, we identified substantial clinical ILI attack rates exceeding 20% with secondary household attack rates as high as 50% in young children. The serial interval was short suggesting a narrow period to prevent transmission.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».