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Enregistrement W1921922278 · doi:10.1139/cjpp-2013-0128

Pharmacogenotyping of <i>CYP3A5</i> in predicting dose-adjusted trough levels of tacrolimus among Malaysian kidney-transplant patients

2013· article· en· W1921922278 sur OpenAlexvenueno aff
Sharina Hamzah, Lay Kek Teh, John Shia Kwong Siew, Ghazali Ahmad, Zainul Amiruddin Zakaria, Mohd Zaki Salleh

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Physiology and Pharmacology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKementerian Kesihatan Malaysia
Mots-clésTacrolimusCalcineurinCYP3A5MedicineInternal medicineGastroenterologyKidneyKidney transplantationKidney transplantTrough levelGenotypeTransplantationPharmacologyBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tacrolimus (FK506) is a calcineurin inhibitor with a narrow therapeutic index that exhibits large interindividual variation. Seventy-eight kidney transplant patients treated with tacrolimus were recruited to study the correlation of dose adjusted trough level (level/dose; L/D) of tacrolimus with CYP3A5 and ABCB1 genotypes, as well as the mRNA copy number of ABCB1 in blood. Patients were genotyped for ABCB1 (C1236T, G2677T/A, and C3435T) and CYP3A5 (G6986A), while ABCB1 mRNA transcript copy number was determined by absolute quantification (real-time PCR) in 46 patients. CYP3A5*3 genotypes were found to be a good predictor of tacrolimus L/D in kidney-transplant patients. Significantly higher L/D was observed among non-expressors (2.85, 95%: 2.05-3.70 (ng·mL(-1))/(mg·kg(-1))) as compared with the expressors (1.15, 95%: 0.95-1.80 (ng·mL(-1))/(mg·kg(-1))) of CYP3A5 (Mann-Whitney U test; P < 0.001). No correlation was observed between L/D and the ABCB1 genotypes. A significant inverse correlation of blood ABCB1 mRNA level with L/D was demonstrated (Spearman's Rank Order correlation; P = 0.016, rs = -0.348). However, in multiple regression analysis, only CYP3A5*3 genotype groups were found to be significantly correlated with tacrolimus L/D (P < 0.001). These findings highlight the importance of CYP3A5*3 pharmacogenotyping among kidney-transplant patients treated with tacrolimus, and confirm the role of blood cell P-glycoprotein in influencing the L/D for tacrolimus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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