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Enregistrement W1922116793 · doi:10.1111/j.1750-2659.2010.00161.x

Original Article: Highly conserved cross‐reactive CD4+ T‐cell HA‐epitopes of seasonal and the 2009 pandemic influenza viruses

2010· article· en· W1922116793 sur OpenAlexafffund
Venkata R. Duvvuri, Seyed M. Moghadas, Hongbin Guo, Bhargavi Duvvuri, Jane M. Heffernan, David N. Fisman, Gillian E. Wu

Notice bibliographique

RevueInfluenza and Other Respiratory Viruses · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaNational Research Council CanadaNational Research Council Institute for BiodiagnosticsMarch of Dimes CanadaPublic Health OntarioYork UniversityUniversity of WinnipegUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsArthritis SocietyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésEpitopeVirologyHemagglutinin (influenza)Cross-reactivityBiologyInfluenza A virusPandemicOriginal antigenic sinImmune systemVirusT cellAntibodyImmunologyAntigenic driftCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineDiseaseCross reactions

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The relatively mild nature of the 2009 influenza pandemic (nH1N1) highlights the overriding importance of pre-existing immune memory. The absence of cross-reactive antibodies to nH1N1 in most individuals suggests that such attenuation may be attributed to pre-existing cellular immune responses to epitopes shared between nH1N1 virus and previously circulating strains of inter-pandemic influenza A viruses. RESULTS: We sought to identify potential CD4+ T cell epitopes and predict the level of cross-reactivity of responding T cells. By performing large-scale major histocompatibility complex II analyses on Hemagglutinin (HA) proteins, we investigated the degree of T-cell cross-reactivity between seasonal influenza A (sH1N1, H3N2) from 1968 to 2009 and nH1N1 strains. Each epitope was examined against all the protein sequences that correspond to sH1N1, H3N2, and nH1N1. T-cell cross-reactivity was estimated to be 52%, and maximum conservancy was found between sH1N1 and nH1N1 with a significant correlation (P < 0.05). CONCLUSIONS: Given the importance of cellular responses in kinetics of influenza infection in humans, our findings underscore the role of T-cell assays for understanding the inter-pandemic variability in severity and for planning treatment methods for emerging influenza viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,715
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,004
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,134
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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