Original Article: Highly conserved cross‐reactive CD4+ T‐cell HA‐epitopes of seasonal and the 2009 pandemic influenza viruses
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The relatively mild nature of the 2009 influenza pandemic (nH1N1) highlights the overriding importance of pre-existing immune memory. The absence of cross-reactive antibodies to nH1N1 in most individuals suggests that such attenuation may be attributed to pre-existing cellular immune responses to epitopes shared between nH1N1 virus and previously circulating strains of inter-pandemic influenza A viruses. RESULTS: We sought to identify potential CD4+ T cell epitopes and predict the level of cross-reactivity of responding T cells. By performing large-scale major histocompatibility complex II analyses on Hemagglutinin (HA) proteins, we investigated the degree of T-cell cross-reactivity between seasonal influenza A (sH1N1, H3N2) from 1968 to 2009 and nH1N1 strains. Each epitope was examined against all the protein sequences that correspond to sH1N1, H3N2, and nH1N1. T-cell cross-reactivity was estimated to be 52%, and maximum conservancy was found between sH1N1 and nH1N1 with a significant correlation (P < 0.05). CONCLUSIONS: Given the importance of cellular responses in kinetics of influenza infection in humans, our findings underscore the role of T-cell assays for understanding the inter-pandemic variability in severity and for planning treatment methods for emerging influenza viruses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».