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Enregistrement W1923711010 · doi:10.1016/s0022-2275(20)32406-8

Functional significance of Sp1, Sp2, and Sp3 transcription factors in regulation of the murine CTP:phosphocholine cytidylyltransferase α promoter

2000· article· en· W1923711010 sur OpenAlexafffund
Marica Bakovic, Kristin Waite, Dennis E. Vance

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésTranscription factorTranscription (linguistics)PhosphocholineActivator (genetics)Molecular biologySp1 transcription factorBiologyPromoterGeneGene expressionResponse elementRegulation of gene expressionCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The transcription factor Sp1 has been implicated in regulation of the expression of the murine CTP:phosphocholine cytidylyltransferase alpha (CTalpha) gene, Ctpct (M. Bakovic, K. Waite, W. Tang, I. Tabas, and D. E. Vance. 1999. Biochim. Biophys. Acta. 1438: 147;-165). We have utilized transient transfections, mutation analysis, electromobility gel-shifts, and immunoblot analysis to test the hypothesis that expression of the CTalpha gene is controlled in part by the binding of three trans-acting nuclear factors, Sp1, Sp2, and Sp3. Sp1 and Sp3 activate CTalpha gene transcription through sequence specific binding within three promoter domains. In Sp1-mediated transcription, Sp3 acts as an activator in a dose-dependent manner and vice versa. Sp2 represses Sp1- and Sp3-driven transcription in Drosophila SL2 cells, but stimulates transcription in C3H10T1/2 mammalian cells. Our results suggest that the predominant action of Sp proteins is a direct function of local organization of three cis-acting elements in the regions A (-31/-9), B (-88/-50), and C (-148/-128). The ability of distal C (-148/-128) and proximal A (-31/-9) regions to activate or repress transcription depends upon the cellular background. The multiple binding elements at position B (-88/-50) confer a positive regulation independent of the cell context. However, the effectiveness of Sp proteins at this site is strongly governed by neighboring sites A and C. The results suggest that the level of expression of the CTalpha gene will depend on the cell type, the availability of Sp proteins, and the structure and organization of three cis-acting elements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,153
Score d'incertitude au seuil0,387

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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