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Enregistrement W1923721795 · doi:10.1111/cge.12482

Phenotypic spectrum associated with <i><scp>PTCHD1</scp></i> deletions and truncating mutations includes intellectual disability and autism spectrum disorder

2014· article· en· W1923721795 sur OpenAlexafffund
Ayeshah Chaudhry, Abdul Noor, Bryan Degagne, Kate Baker, Levinus A. Bok, Angela F. Brady, David Chitayat, Brian Hon‐Yin Chung, Cheryl Cytrynbaum, David A. Dyment, Isabel Filges, Benjamin M. Helm, H. Terry Hutchison, LJB Jeng, Frédéric Laumonnier, Christian R. Marshall, M. Menzel, Sandhya Parkash, Michael Parker, Lucy F. Raymond, Andrea L. Rideout, Wendy Roberts, Rosemarie Rupps, Ina Schanze, C. T. R. M. Schrander‐Stumpel, Marsha Speevak, Dimitri J. Stavropoulos, Servi J.C. Stevens, Elizabeth R. Thomas, Annick Toutain, Samantha A. Schrier Vergano, Rosanna Weksberg, Stephen W. Scherer, John B. Vincent, M. T. Carter

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchCredit Valley HospitalTrillium Health CentreChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaIzaak Walton Killam Health CentreChildren's Hospital of Eastern OntarioDalhousie UniversityOntario Medical AssociationSickKids FoundationUniversity of TorontoMount Sinai HospitalCentre for Addiction and Mental HealthUniversity of British ColumbiaHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesFondation de FranceEuropean CommissionCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaNational Institute for Health and Care ResearchWellcomeOntario Genomics InstituteAcademy of Medical SciencesWellcome Trust
Mots-clésIntellectual disabilityAutism spectrum disorderHypotoniaAutismNeurodevelopmental disorderGeneticsPhenotypePsychologyCopy-number variationGlobal developmental delayDevelopmental disorderNeuropsychologyPervasive developmental disorderCognitionNeuroscienceBiologyPsychiatryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies of genomic copy number variants (CNVs) have identified genes associated with autism spectrum disorder (ASD) and intellectual disability (ID) such as NRXN1, SHANK2, SHANK3 and PTCHD1. Deletions have been reported in PTCHD1 however there has been little information available regarding the clinical presentation of these individuals. Herein we present 23 individuals with PTCHD1 deletions or truncating mutations with detailed phenotypic descriptions. The results suggest that individuals with disruption of the PTCHD1 coding region may have subtle dysmorphic features including a long face, prominent forehead, puffy eyelids and a thin upper lip. They do not have a consistent pattern of associated congenital anomalies or growth abnormalities. They have mild to moderate global developmental delay, variable degrees of ID, and many have prominent behavioral issues. Over 40% of subjects have ASD or ASD-like behaviors. The only consistent neurological findings in our cohort are orofacial hypotonia and mild motor incoordination. Our findings suggest that hemizygous PTCHD1 loss of function causes an X-linked neurodevelopmental disorder with a strong propensity to autistic behaviors. Detailed neuropsychological studies are required to better define the cognitive and behavioral phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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