Tn<i>10</i>/IS<i>10</i> transposition is downregulated at the level of transposase expression by the RNA‐binding protein Hfq
Notice bibliographique
Résumé
We show in this work that disruption of the hfq gene in Escherichia coli causes a large increase in IS10 transposition when IS10 is present on a multi-copy plasmid. Hfq is an RNA-binding protein that regulates the expression of a large number of genes at the post-transcriptional level by promoting the pairing of mRNAs with partially complementary short RNAs. As the translation of IS10 transposase mRNA (RNA-IN) is inhibited by an IS10-encoded anti-sense RNA (RNA-OUT), it seemed likely that Hfq would negatively regulate Tn10/IS10 transposition by promoting anti-sense inhibition of RNA-IN translation. Consistent with this, we show that Hfq promotes pairing of RNA-IN and RNA-OUT in vitro and downregulates RNA-IN expression in vivo. However, we also show that Hfq negatively regulates Tn10 transposition when no functional anti-sense RNA is produced. Taken together, the results suggest that Hfq acts at two distinct steps to inhibit Tn10/IS10 transposition. This is the first example of Hfq regulating a bacterial transposition reaction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».