Evaluating genetic variation and relationships among<i>Puccinellia nuttalliana</i>populations using amplified fragment length polymorphism markers
Notice bibliographique
Résumé
Liu, Y., Fu, Y.-B. and Coulman, B. E. 2013. Evaluating genetic variation and relationships among Puccinellia nuttalliana populations using amplified fragment length polymorphism markers. Can. J. Plant Sci. 93: 1097–1104. Nuttall's salt-meadow, or alkali grass [Puccinellia nuttalliana (Shultes) Hitchc.], is a native grass species in North America, well known for its salt tolerance. Little information is available about the genetic diversity of natural populations of this species. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers were used to examine the inter-population relationships and to compare variances within and among 23 populations collected from the Canadian Great Plains. Five AFLP primer pairs were employed to screen 15 genotypes (five sets of three half-sib plants) from each population, and 185 polymorphic AFLP bands were scored for each sample. The frequencies of these scored bands ranged from 0.02 to 0.99 with a mean of 0.60. The analysis of molecular variance revealed more than 96% of the total AFLP variation resided within populations. Populations were not highly differentiated with only 4% of the total AFLP variation residing among populations. A Mantel test revealed a significant but low correlation between genetic and geographic distances (r=0.29, P=0.024). Implications for P. nuttalliana conservation, germplasm sampling, and cultivar development are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».