MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W1928428494 · doi:10.4212/cjhp.v55i1.532

The Human Genome Project

2002· article· en· W1928428494 sur OpenAlexvenueno aff
Scott Walker

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Journal of Hospital Pharmacy · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHuman genomeGenomeGeneticsGenome projectDNA sequencingBase pairGeneDNASequence (biology)Computational biologyBiologyReference genome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human chromosomes contain the DNA for thousands of individual genes. Each gene is a segment of double-stranded DNA that holds the code for making a specific molecule, usually a protein. The code is spelled out in various sequences of the 4 chemical bases in DNA: adenine (A), thymine (T), guanine (G), and cytosine (C). In 1990 the Human Genome Project was initiated. Its goal was to determine the complete nucleotide sequence of DNA and to localize the estimated 50 000 to 100 000 genes within the human genome. The initial 5-year research plan set specific goals for what was expected to be a 15-year project. The first and second 5-year plans outlined the intention to sequence the human genome and study genetic variation and functional analysis of the genome. It is now anticipated that the 15-year project will be finished ahead of schedule, in 2003, just 50 years after the discovery of the double-helix structure of DNA by Watson and Crick. However, it is possible that less than the totality of the genome will have been decoded by then, because some areas, such as the centromeres, are not amenable to automated assembly because of their highly repetitive sequences. Determining the base-pair sequence of a strand of DNA is not entirely straightforward. Today’s most popular method for base-pair sequencing was reported in 1977 by Sanger and others. This method involves replicating each strand of DNA, adding a known base-pair sequence to each strand, and dividing the replicates into 4 groups. Nucleotide bases are then added, and base pairing begins. Each nucleotide base has a complementary base with which it can pair (A pairs with T, and G pairs with C). However, base pairing can be halted by means of a specific chain terminator — a modified nucleotide of adenine, thymine, guanine, or cytosine. Because pairing halts where the chain terminator binds, chains of various sizes are created by the chain terminator. To 1 of the original 4 groups, only an adenine chain terminator is added, such that chains in that group halt where the chain terminator of A is paired. The same process is followed for the other 3 groups and the other 3 chain terminators. All 4 groups of DNA fragments are then separated according to their size by means of electrophoresis. Starting with the smallest piece, the chain terminator is “read”. If the smallest piece appears in the “A” column, then the first nucleotide in the chain is adenosine. This process continues until the entire code of the original piece is determined. About 1 year ago, 2 groups of researchers simultaneously published their DNA sequence results. In fact, neither group had completely sequenced all human DNA. Many small portions of the highly The Human Genome Project

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil0,502

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,009
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1500,114

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Canadian Journal of Hospital Pharmacy→Même sujetGenomics and Chromatin Dynamics→Travaux en français237 207→