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Enregistrement W1929251091 · doi:10.1111/j.1742-4658.2007.05804.x

Involvement of NF‐κB subunit p65 and retinoic acid receptors, RARα and RXRα, in transcriptional regulation of the human <i>GnRH II</i> gene

2007· article· en· W1929251091 sur OpenAlexaff
Ruby L.C. Hoo, Kathy Yuen Yee Chan, Francis K. Y. Leung, Leo T. O. Lee, Peter C. K. Leung, Bkc Chow

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRetinoic acidBiologyRepressorMolecular biologyRetinoid X receptorRetinoic acid receptorGeneGene expressionNuclear receptorTranscription factorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gonadotropin-releasing hormone (GnRH) I and II are hypothalamic decapeptides with pivotal roles in the development of reproductive competence and regulation of reproductive events. In this study, transcriptional regulation of the human GnRH II gene was investigated. By scanning mutation analysis coupled with transient promoter assays, the motif at -641/-636 (CATGCC, designated GII-Sil) was identified as a repressor element. Mutation of this motif led to full restoration of promoter activity in TE671 medulloblastoma and JEG-3 placenta choriocarcinoma cells. Supershift and chromatin immunoprecipitation assays showed in vitro and in vivo binding of NF-kappaB subunit p65 and the retinoic acid receptors, RARalpha and RXRalpha, to the promoter sequences. Over-expression of these protein factors indicated that p65 is a potent repressor, and the RARalpha/RXRalpha heterodimer is involved in the differential regulation of the GnRH II gene in neuronal and placental cells. This was confirmed by quantitative real-time PCR. Treatment of cells with the RARalpha/RXRalpha ligands, all-trans retinoic acid and 9-cis-retinoic acid, reduced and increased GnRH II gene expression in TE671 and JEG-3 cells, respectively. Taken together, these data demonstrate the differential roles of NF-kappaB p65 and RARalpha/RXRalpha, interacting with the same sequence in the promoter of the human GnRH II gene to influence gene expression in a cell-specific manner.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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