Functional evaluation of the role of C-type lectin domain family 16A at the chromosome 16p13 locus
Notice bibliographique
Résumé
The type 1 diabetes-associated 16p13 locus contains the CLEC16A gene. Its preferential immune cell expression suggests involvement in autoimmunity. Given its elevated expression in dendritic and B cells - known professional antigen-presenting cells (APCs) - we hypothesize that C-type lectin domain family 16 member A (CLEC16A) may be involved in T cell co-stimulation and consequent activation and proliferation. We also sought to identify CLEC16A's subcellular localization. The effect of the CLEC16A knock-down (KD) on B cell co-stimulation and activation of T cells was tested in human lymphoblastoid cell lines (LCLs) by co-culture with CD4(+) T cells. T cell activation and proliferation were determined by flow-cytometric analysis of CD69 and CD25 expression and carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE) dilution, respectively. CLEC16A subcellular localization in K562 cells was examined by immunofluorescence. We show that the CLEC16A KD did not affect the tested indices of lymphoblastoid cell line (LCL) APC capacity. Additionally, the percentage of activated T cells following LCL co-culture was not affected significantly by the CLEC16A KD. T cells co-cultured with KD or control LCLs also exhibited similar cell division profiles. CLEC16A co-localized with an endoplasmic reticulum (ER) marker, suggesting that it may be an ER protein. In conclusion, CLEC16A may not be involved in T cell co-stimulation. Additional studies on CLEC16A, accounting for its ER localization, are needed to uncover its biological role.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».