A standardized autopsy procurement allows for the comprehensive study of DIPG biology
Notice bibliographique
Résumé
// Madhuri Kambhampati 1 , Jennifer P. Perez 1 , Sridevi Yadavilli 1 , Amanda M. Saratsis 1,2,3 , Ashley D. Hill 4 , Cheng-Ying Ho 4 , Eshini Panditharatna 1,7 , Melissa Markel 5 , Roger J. Packer 6 and Javad Nazarian 1,8 1 Research Center for Genetic Medicine, Children’s National Health System, Washington, DC, USA 2 Division of Pediatric Neurosurgery, Ann & Robert H. Lurie Children’s Hospital of Chicago, Chicago, IL, USA 3 Department of Neurological Surgery, Northwestern University Feinberg School of Medicine, Chicago, IL, USA 4 Division of Pathology, Children’s National Health System, Washington, DC, USA 5 Department of Neuro Oncology, Riley hospital for Children, Indiana University Health, Indianapolis, IN USA 6 Brain Tumor Institute, Center for Neuroscience and Behavioral Medicine, Children’s National Health System, Washington, DC, USA 7 Institute for Biomedical Sciences, George Washington University, Washington, DC, USA 8 Department of Integrative Systems Biology, George Washington University School of Medicine and Health Sciences, Washington, DC, USA Correspondence to: Javad Nazarian, email: // Keywords : Diffuse Intrinsic Pontine Glioma (DIPG), Brainstem Glioma, Autopsy, Histone 3, Orthotopic Injection Received : December 09, 2014 Accepted : January 15, 2015 Published : January 24, 2015 Abstract Diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG) is one of the least understood and most deadly childhood cancers. Historically, there has been a paucity of DIPG specimens for molecular analysis. However, due to the generous participation of DIPG families in programs for postmortem specimen donation, there has been a recent surge in molecular analysis of newly available tumor specimens. Collaborative efforts to share data and tumor specimens have resulted in rapid discoveries in other pediatric brain tumors, such as medulloblastoma, and therefore have the potential to shed light on the biology of DIPG. Given the generous gift of postmortem tissue donation from DIPG patients, there is a need for standardized postmortem specimen accrual to facilitate rapid and effective multi-institutional molecular studies. We developed and implemented an autopsy protocol for rapid procurement, documenting and storing these specimens. Sixteen autopsies were performed throughout the United States and Canada and processed using a standard protocol and inventory method, including specimen imaging, fixation, snap freezing, orthotopic injection, or preservation. This allowed for comparative clinical and biological studies of rare postmortem DIPG tissue specimens, generation of in vivo and in vitro models of DIPG, and detailed records to facilitate collaborative analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».