Strategies and tools for studying the metabolism and function of γ-aminobutyrate in plants. II. Integrated analysis
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
γ-Aminobutyrate (GABA) is a ubiquitous nonprotein amino acid that accumulates in plants in response to abiotic and biotic stresses. In a companion paper, we discussed the origin of GABA from glutamate and subsequent catabolism to succinic semialdehyde and either succinate or γ-hydroxybutyrate (GHB), and the characteristics of genes and proteins responsible for GABA permease, glutamate decarboxylase, GABA transaminase, succinic semialdehyde dehydrogenase, and succinic semialdehyde reductase activities. In this paper, we explore gene expression and transcript–metabolite relationships during the response to abiotic stress, and describe phenotypes of genetic mutants and relationships of GABA metabolism to other plant functions. Evidence indicates that both gene-dependent and -independent processes are involved in the response of the GABA pathway to abiotic stresses. Study of stress-specific responses and their interplay with the C/N network and various signalling pathways would be more informative if circadian rhythms and light–dark transitions upon imposition of the stress were always taken into account, and relevant genes and metabolites simultaneously profiled in wild-type plants or genetic mutants.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle