Identification of three novel human leukocyte antigen alleles, <i>HLA‐B*58:43</i>, <i>HLA‐C*03:190</i>, and <i>HLA‐DPA1*01:12</i>, in an East African cohort
Notice bibliographique
Résumé
Three novel human leukocyte antigen (HLA) alleles were identified using a sequence-based typing of HLA class I and class II alleles of 1867 participants from a male circumcision cohort in Kenya. The new alleles were first identified by sequencing and then confirmed by cloning the polymerase chain reaction (PCR) products and sequencing multiple clones. HLA-B*58:43 was identical to HLA-B*58:02 with the exception of a nucleotide change at codon 125 in exon 3 (GCC→ACC), and resulted in the amino acid change from Alanine to Threonine. HLA-C*03:190 was identical to HLA-C*03:02:01 with the exception of a nucleotide change at codon 131 in exon 3 (CGC→TGC), and resulted in the amino acid change from Arginine to Cysteine. HLA-DPA1*01:12 was identical to HLA-DPA1*01:03:01:01 with the exception of a nucleotide change at codon 66 in exon 2 (TTG→TCG), and resulted in the amino acid change from Leucine to Serine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».