The quaternary structure of RNase G from <i> Escherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
RNase G is the endoribonuclease responsible for forming the mature 5' end of 16S rRNA. This enzyme shares 35% identity with and 50% similarity to the N-terminal 470 amino acids encompassing the catalytic domain of RNase E, the major endonuclease in Escherichia coli. In this study, we developed non-denaturing purifications for overexpressed RNase G. Using mass spectrometry and N-terminal sequencing, we unambiguously identified the N-terminal sequence of the protein and found that translation is initiated at the second of two potential start sites. Using velocity sedimentation and oxidative cross-linking, we determined that RNase G exists largely as a dimer in equilibrium with monomers and higher multimers. Moreover, dimerization is required for activity. Four of the six cysteine residues of RNase G were mutated to serine. No single cysteine to serine mutation resulted in a complete loss of cross-linking, dimerization or activity. However, multiple mutations in a highly conserved cluster of cysteines, including C405 and C408, resulted in a partial loss of activity and a shift in the distribution of RNase G multimers towards monomers. We propose that many of the cysteines in RNase G lie on its surface and define, in part, the subunit-subunit interface.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».