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Enregistrement W1933155703 · doi:10.1155/2006/152612

An Outbreak of Human Coronavirus OC43 Infection and Serological Cross‐Reactivity with SARS Coronavirus

2006· article· en· W1933155703 sur OpenAlexafffund
David M. Patrick, Martin Petric, Danuta M. Skowronski, Roland Guasparini, Timothy F. Booth, Mel Krajden, Patrick L. McGeer, Nathalie Bastien, Larry Gustafson, Janet Dubord, Diane Macdonald, Samara David, Leila F Srour, Robert A. Parker, Anton Andonov, Judith L. Isaac‐Renton, Nadine Loewen, Gail McNabb, A. McNabb, Swee-Han Goh, Scott Henwick, Caroline R. Astell, Jian Guo, Michael Drebot, Raymond Tellier, Francis A. Plummer, Robert C. Brunham

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensSickKids FoundationBC Cancer AgencyHospital for Sick ChildrenUniversity of British ColumbiaBC Centre for Disease ControlSurrey Memorial HospitalPublic Health Agency of CanadaFraser Health
Organismes subventionnairesBritish Columbia Centre for Disease Control
Mots-clésSerologyVirologyCoronavirusOutbreakPneumoniaAntibodyBetacoronavirusCross-reactivityPolymerase chain reactionBiologyMiddle East respiratory syndrome coronavirusMedicineImmunologyCross reactionsGeneCoronavirus disease 2019 (COVID-19)PathologyInfectious disease (medical specialty)DiseaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In summer 2003, a respiratory outbreak was investigated in British Columbia, during which nucleic acid tests and serology unexpectedly indicated reactivity for severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV). METHODS: Cases at a care facility were epidemiologically characterized and sequentially investigated for conventional agents of respiratory infection, SARS-CoV and other human CoVs. Serological cross-reactivity between SARS-CoV and human CoV-OC43 (HCoV-OC43) was investigated by peptide spot assay. RESULTS: Ninety-five of 142 residents (67%) and 53 of 160 staff members (33%) experienced symptoms of respiratory infection. Symptomatic residents experienced cough (66%), fever (21%) and pneumonia (12%). Eight residents died, six with pneumonia. No staff members developed pneumonia. Findings on reverse transcriptase-polymerase chain reaction assays for SARS-CoV at a national reference laboratory were suspected to represent false positives, but this was confounded by concurrent identification of antibody to N protein on serology. Subsequent testing by reverse transcriptase-polymerase chain reaction confirmed HCoV-OC43 infection. Convalescent serology ruled out SARS. Notably, sera demonstrated cross-reactivity against nucleocapsid peptide sequences common to HCoV-OC43 and SARS-CoV. CONCLUSIONS: These findings underscore the virulence of human CoV-OC43 in elderly populations and confirm that cross-reactivity to antibody against nucleocapsid proteins from these viruses must be considered when interpreting serological tests for SARS-CoV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,876
Score d'incertitude au seuil0,246

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations172
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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