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Enregistrement W1934114385 · doi:10.1139/cjb-2013-0232

Carbon partitioning in tissues of a gain-of-function mutant (<i>MYB75</i>/<i>PAP1-D</i>) and a loss-of-function mutant (<i>myb75-1</i>) in<i>Arabidopsis thaliana</i>

2013· article· en· W1934114385 sur OpenAlexafffundvenue
Houman Fei, Brian E. Ellis, J. Kevin Vessey

Notice bibliographique

RevueBotany · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaSaint Mary's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPhenylpropanoidMutantArabidopsis thalianaXylemBiologyBiochemistryCytoplasmCell wallArabidopsisBotanyMYBVacuoleWild typeBiosynthesisCell biologyTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of myeloblastosis (MYB) transcription factors in regulation of carbon flow among the various products of the phenylpropanoid pathway is still unclear. Carbon partitioning in Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. was studied in a gain-of-function mutant (MYB75/PAP1-D) and a loss-of-function mutant (myb75-1). Determination of anthocyanins and total phenolics levels in leaf, peduncle, and root tissues of these mutants and their wild-type (WT) parental lines was assessed, as well as 13 C partitioning between “extractives” (predominantly cytoplasm) and “nonextractives” (predominantly cell wall) of these tissues. The amounts of anthocyanins and phenolics in the leaves and peduncles of MYB75/PAP1-D mutant were higher than in its WT line. 13 C excess in the extractives of leaves and peduncles of the mutant was also higher than that found in the WT line, indicating that the transcription factor MYB75 positively regulated carbon flow to flavonoids biosynthesis in the phenylpropanoid pathway. The myb75-1 mutant had higher distribution of 13 C in both extractives and nonextractives of leaves and peduncles, especially in nonextractives of the peduncles, and lower levels of anthocyanins compared with its WT. This suggests that the knockout of MYB75 inhibits biosynthesis of anthocyanins and regulates carbon flow from cytoplasm to cell wall components by activating the biosynthesis of monolignols in cytoplasm, which, in turn, are transported and deposited to the secondary cell wall, resulting in secondary cell wall thickening. Patterns of anthocyanin level and 13 C partitioning in roots were different from that seen in leaves and peduncles, suggesting that regulation of the phenylpropanoid pathway by MYB75 may be tissue specific.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,913

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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