Association analyses of single nucleotide polymorphisms in bovine <i>stearoyl‐CoA desaturase</i> and <i>fatty acid synthase</i> genes with fatty acid composition in commercial cross‐bred beef steers
Notice bibliographique
Résumé
Two previously reported non-synonymous coding single nucleotide polymorphisms (SNPs) of bovine stearoyl-CoA desaturase (delta-9-desaturase) (SCD) (c.878C>T) and fatty acid synthase (FASN) (g:17924A>G) were assessed for their associations with 72 individual and 12 groups of fatty acids in brisket adipose tissue of 223 Canadian commercial cross-bred beef steers. It was found that the 'CC' genotype of the SCD SNP was significantly associated with lower concentrations of saturated fatty acids (SFA) including 10:0, 14:0 and 20:0, higher concentrations of monounsaturated fatty acids including 9c-14:1, 12c-16:1 and 13c-18:1, higher concentrations of polyunsaturated fatty acids (PUFA) including 9c,15c-18:2, 10c,12c-18:2, 11c,13t-18:2 and 12c,14t-18:2, but lower concentrations of other PUFA of 9c,13t/8t,12c and 20:2n-6 (P < 0.05). The 'AA' genotype of the FASN SNP was significantly associated with higher concentrations of SFAs of 10:0, 12:0, 13:0, 14:0 and 15:0, lower concentrations of unsaturated fatty acids of 9c-18:1 and 20:3n-6, and higher concentrations of unsaturated fatty acids of 9c-14:1 and 12c-16:1 (P < 0.05). Significant epistatic effects between the SCD and FASN SNP genotypes were also found for several fatty acids including 10:0, 23:0, 6t/7t/8t-18:1, 12t-18:1, 13t/14t-18:1, 16t-18:1, total trans18:1 and 9c,13t/8t,12c-18:2 (P < 0.05). These results further suggest that SCD and FASN are strong candidate genes influencing fatty acid composition in beef cattle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».