MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1934407509 · doi:10.1016/j.febslet.2015.05.051

VirB6 and VirB10 from the <i>Brucella</i> type IV secretion system interact via the N‐terminal periplasmic domain of VirB6

2015· article· en· W1934407509 sur OpenAlexafffund
Ana M. Villamil Giraldo, Charline Mary, Durgajini Sivanesan, Christian Baron

Notice bibliographique

RevueFEBS Letters · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchConcordia University
Mots-clésPeriplasmic spaceSecretionTerminal (telecommunication)Domain (mathematical analysis)BrucellaChemistryBrucella abortusCell biologyType VI secretion systemMicrobiologyBiochemistryBiologyComputer scienceBrucellosisVirologyEscherichia coliMathematicsGeneVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type IV secretion systems are multi-protein complexes that transfer macromolecules across the cell envelope of bacteria. Identifying the sites of interaction between the twelve proteins (VirB1-VirB11 and VirD4) that form these complexes is key to understanding their assembly and function. We have here used phage display, bacterial two-hybrid and fluorescence-based interaction assays to identify an N-terminal domain of the inner membrane protein VirB6 as a site of interaction with the envelope-spanning VirB10 protein. Our results are consistent with the notion that VirB6 acts in concert with VirB10 as well as with VirB8 during secretion system assembly and function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,322
Score d'incertitude au seuil0,383

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFEBS LettersMême sujetBacterial Genetics and BiotechnologyTravaux en français237 207