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Enregistrement W1934498590 · doi:10.1139/cjm-2012-0465

Aminoglycoside resistance mechanisms in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> isolates from non-cystic fibrosis patients in Thailand

2012· article· en· W1934498590 sur OpenAlexvenueno aff
Kanchana Poonsuk, Chanwit Tribuddharat, Rungtip Chuanchuen

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionRoyal Golden Jubilee (RGJ) Ph.D. ProgrammeThailand Research FundChulalongkorn University
Mots-clésPseudomonas aeruginosaMicrobiologyTobramycinBiologyKanamycinEffluxAmikacinAminoglycosideGentamicinAntibioticsBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study aimed to examine aminoglycosides (AMGs) resistance mechanisms, including the AMG-modifying enzyme genes, mexXY, rplY, nuoG, and galU, in the Pseudomonas aeruginosa non-cystic fibrosis (CF) isolates in Thailand. One hundred P. aeruginosa isolates from non-CF patients were examined for susceptibility to AMGs and for the presence of 10 AMG-modifying enzyme genes. Thirty randomly selected isolates were tested for transcription of mexXY and nuoG and mutations in rplY and galU. All the P. aeruginosa isolates exhibited simultaneous resistance to at least 4 AMGs. High resistance rates to amikacin (92%), gentamicin (95%), streptomycin (99%), and tobramycin (96%) were observed, and all isolates were resistant to kanamycin, neomycin, and spectinomycin. Nine AMG-modifying enzyme genes were detected, including aadA1 (84%), aadB (84%), aadA2 (67%), ant(2″)-Ia (72%), strA-strB (70%), aph(3')-IIb (57%), aac(3')-Ia (40%), and aac(6')-IIa (27%). None of the isolates harbored aac(6')-IIb. Of 30 isolates tested, all but 1 isolate expressed MexXY. Two isolates did not express nuoG. Six isolates carried an amino acid change in RplY, but none of the isolates harbored mutation in galU. The results indicated that the AMG-modifying enzyme genes were widespread among the P. aeruginosa non-CF isolates. The MexXY efflux pump and inactivation for rplY played a role in AMG resistance but disruption of nuoG or galU did not.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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