Impact of temperature on the expression of Kennedy Pathway genes in developing soybean seeds
Notice bibliographique
Résumé
McNaughton, A. J. M., Shelp, B. J. and Rajcan, I. 2015. Impact of temperature on the expression of Kennedy Pathway genes in developing soybean seeds. Can. J. Plant Sci. 95: 87–101. The main oil storage molecule, triacylglycerol (TAG), can be created by the Kennedy Pathway. The objective of this study was to determine the impact of growing temperature on the expression of the Kennedy Pathway genes, glycerol-3-phosphate acyltransferase (G3PAT), lysophosphatidic acid acyltransferase (LPAAT), and diacylglycerol acyltransferase 1 (DGAT1), in developing seed of four soybean genotypes with altered fatty acid composition using quantitative polymerase chain reaction. The three growing temperatures were: high, 30°C day/25°C night; normal, 25°C day/20°C night; and low, 20°C day/15°C night. The expression of G3PAT steadily declined following 15 d after flowering (DAF), suggesting that it is likely to be more highly expressed earlier in development than was measured in the study. As a result, the expression of G3PAT did not correspond to fatty acid accumulation. LPAAT expression coincided with accumulation of oleic acid (18:1∆9) and linolenic acid (18:3∆9,12,15) in a temperature-dependent manner. The expression of DGAT1 corresponded to accumulation of linoleic acid (18:2∆9,12), which varied among the soybean genotypes, indicating a genotypic effect on the expression of DGAT1. This study suggests that the expression of the acyltransferase enzymes of the Kennedy Pathway influences the fatty acid composition in seed of four altered fatty acid soybean genotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».