The Pseudomonas aeruginosa alternative sigma factor PvdS controls exotoxin A expression and is expressed in lung infections associated with cystic fibrosis
Notice bibliographique
Résumé
PvdS is an alternative sigma factor regulated by the global iron regulator Fur. It has been demonstrated that PvdS plays a role in the iron-dependent regulation of exotoxin A (ETA) in Pseudomonas aeruginosa strain PAO1. The goals of this research were to determine if pvdS was transcribed by the bacteria in the chronic lung infections associated with cystic fibrosis (CF) and to determine how PvdS interacts with the regAB promoters of the hyper-toxigenic strain PA103. It was found that pvdS is transcribed in the lungs of patients with CF and that it appears to be involved with the regulation of toxA in this environment. This correlated with the finding that in strain PA103, a mutation in pvdS reduced ETA activity while the same mutation in strain PAO1 abrogated ETA production. It was also shown that in strain PA103, pvdS was absolutely required for activation of the regAB P2 promoter. The effect of PvdS on the P2 promoter may be direct or indirect; however, in support of a direct role, an eight-out-of-nine base-pair match to the consensus sequence for PvdS binding was identified at the transcriptional start site for the P2 promoter. The effect of PvdS on the PA103 regAB P1 promoter under aerobic growth conditions was also examined. The results show that PvdS does modulate the expression from this promoter but that both the regAB operon and PvdS are required for optimal P1 promoter activity. These studies demonstrate that the alternative sigma factor PvdS acts as a regulator of ETA expression in P. aeruginosa strain PA103 through the regAB operon and that PvdS is expressed in lung infections associated with CF.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».