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Enregistrement W1938515013 · doi:10.1002/jbmr.2604

Two Rare Mutations in the<i>COL1A2</i>Gene Associate With Low Bone Mineral Density and Fractures in Iceland

2015· article· en· W1938515013 sur OpenAlexaff
Unnur Styrkársdóttir, Guðmar Þorleifsson, Berglind Eiríksdottir, Sigurjón A. Guðjónsson, Þorvaldur Ingvarsson, Tuan V. Nguyen, John A. Eisman, Claus Christiansen, Unnur Þorsteinsdóttir, Gunnar Sigurðsson

Notice bibliographique

RevueJournal of Bone and Mineral Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensAmgen (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsteogenesis imperfectaBone mineralMissense mutationOdds ratioMedicineOsteoporosisConfidence intervalBone densityInternal medicineGeneticsEndocrinologyMutationGeneBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We conducted a genome-wide association study of low bone mineral density (BMD) at the hip and spine utilizing sequence variants found through whole-genome sequencing of 2636 Icelanders. We found two rare missense mutations, p.Gly496Ala and p.Gly703Ser, in the COL1A2 gene that associate with measures of osteoporosis in Icelanders. Mutations in COL1A2 are known to cause the autosomal dominant disorder osteogenesis imperfecta. Both variants associate with low BMD and with osteoporotic fractures. p.Gly496Ala (frequency of 0.105%) shows the strongest association with low BMD at the spine (p = 1.8 × 10(-7) , odds ratio [OR] = 4.61 [95% confidence interval (CI) 2.59, 8.18]), whereas p.Gly703Ser (frequency of 0.050%) is most strongly associated with low BMD at the hip (p = 1.9 × 10(-8) , OR = 9.34 [95% CI 4.28, 20.3]). Association with fractures was p = 2.2 × 10(-5) , OR = 3.75 (95% CI 2.03, 6.93) and p = 0.0023, OR = 4.32 (95% CI 1.69, 11.1), respectively. The carriers of these variants do not have signs of osteogenesis imperfecta other than low BMD, demonstrating that similar mutations in COL1A2 can affect skeletal phenotypes in more than one way.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,670
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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