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Enregistrement W1939730235 · doi:10.1099/mic.0.000140

Complex autoregulation of the post-transcriptional regulator RsmA in Pseudomonas aeruginosa

2015· article· en· W1939730235 sur OpenAlexafffund
Fabrice Jean-Pierre, Jonathan Perreault, Éric Déziel

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRegulonPseudomonas aeruginosaBiologyTranscriptional regulationTranslation (biology)RegulatorCell biologyRegulation of gene expressionGenePost-transcriptional regulationTranslational regulationRibosomal binding siteRNA-binding proteinRibosomeFunction (biology)GeneticsRNAMessenger RNAGene expressionBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RsmA is a post-transcriptional RNA-binding protein that acts as a pleiotropic global regulator of mRNAs in the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa. Upon binding to its target, RsmA impedes the translation of the mRNA by the ribosome. The RsmA regulon affects over 500 genes, many of which have been identified as important in the pathogenicity of P. aeruginosa. Whilst the regulatory function of RsmA is relatively well characterized, the genetic regulation of rsmA itself at the transcriptional and translational levels remains poorly understood. Here, we show that RsmA is capable of self-regulation through an unorthodox mechanism. This regulation occurs via direct interaction of the protein with an RsmA-binding site located in the early portion of its coding sequence. To the best of our knowledge this is the first report of such an unusual regulation in pseudomonads.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,205
Score d'incertitude au seuil0,364

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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