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Enregistrement W1939739894 · doi:10.1111/mmi.12593

<scp>TCA</scp> cycle activity in <scp><i>S</i></scp><i>taphylococcus aureus</i> is essential for iron‐regulated synthesis of staphyloferrin <scp>A</scp>, but not staphyloferrin <scp>B</scp>: the benefit of a second citrate synthase

2014· article· en· W1939739894 sur OpenAlexafffund
Jessica R. Sheldon, Cristina L. Marolda, David E. Heinrichs

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSiderophoreMutantBiologyBiochemistryCitric acid cycleBiosynthesisVirulenceMicrobiologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Staphylococcus aureus elaborates two citrate-containing siderophores, staphyloferrin A (SA) and staphyloferrin B (SB), that enhance growth under iron-restriction, yet, paradoxically, expression of the TCA cycle citrate synthase, CitZ, is downregulated during iron starvation. Iron starvation does, however, result in expression of SbnG, recently identified as a novel citrate synthase that is encoded from within the iron-regulated SB biosynthetic locus, suggesting an important role for SbnG in staphyloferrin production. We demonstrate that during growth of S. aureus in iron-restricted media containing glucose, SB is produced but, in contrast, SA production is severely repressed; accordingly, SB-deficient mutants grow poorly in these media. Hypothesizing that reduced TCA cycle activity hinders SA production, we show that a citZ mutant is capable of SB synthesis, but not SA synthesis, providing evidence that SbnG does not generate citrate for incorporation into SA. A citZ sbnG mutant synthesizes neither staphyloferrin, is severely compromised for growth in iron-restricted media, and is significantly more impaired for virulence than either of the single-deletion mutants. We propose that SB is the more important of the two siderophores for S. aureus insofar as it is synthesized, and supports iron-restricted growth, without need of TCA cycle activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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