Molecular Study of Free-ranging Mule Deer and White-tailed Deer from British Columbia, Canada, for Evidence of Anaplasma spp. and Ehrlichia spp.
Notice bibliographique
Résumé
Twenty-three free-ranging white-tailed deer (WTD; Odocoileus virginianus) and six mule deer (MD; Odocoileus hemionus) from south-central British Columbia, Canada, were tested for Anaplasma marginale by msp5 gene-specific PCR and Ehrlichia spp. by 16S rRNA or citrate synthase (gltA) gene-specific PCR, as well as by PCR with universal 16S rRNA primers detecting a wide range of bacteria. No deer tested positive for A. marginale. Amplification with universal 16S rRNA primers followed by sequencing of cloned fragments detected an Anaplasma sp. in one of 23 (4.3%) WTD and six of six (100%) MD and Bartonella sp. in four of 23 (17.4%) WTD. The Anaplasma sp. was genetically distinct from A. marginale and all other recognized members of the genus. Four of six (66.7%) MD and 0 of 23 (0%) WTD were Ehrlichia positive by PCR with primers for 16S rRNA and gltA genes. The sequences of gltA PCR fragments were identical to each other and to the respective region of the gltA gene of an Ehrlichia sp. which we detected previously in naturally infected cattle from the same area, suggesting the possibility of biological transmission of this rickettsia between cattle and wild cervids. Antibodies reactive with the MSP5 protein of A. marginale were detected using a competitive enzyme-linked immunosorbent assay in two of six (33.3%) MD, but not in WTD. The two seropositive MD were PCR positive for both the Anaplasma sp. and Ehrlichia sp. detected in this study, suggesting a reaction of antibodies against one or both of these rickettsias with the MSP5 antigen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».