Quantification of rate constants for successive enzymatic reactions with DNP hyperpolarized MR
Notice bibliographique
Résumé
A kinetic model is provided to obtain reaction rate constants in successive enzymatic reactions that are monitored using NMR spectroscopy and hyperpolarized substrates. The model was applied for simulation and analysis of the successive oxidation of choline to betaine aldehyde, and further to betaine, by the enzyme choline oxidase. This enzymatic reaction was investigated under two different sets of conditions: two different choline molecular probes were used, [1,1,2,2-D4 , 1-(13) C]choline chloride and [1,1,2,2-D4 , 2-(13) C]choline chloride, in different MR systems (clinical scanner and high-resolution spectrometer), as well as in different reactors and reaction volumes (4.8 and 0.7 mL). The kinetic analysis according to the model yielded similar results in both set-ups, supporting the robustness of the model. This was achieved despite the complex and negating influences of reaction kinetics and polarization decay, and in the presence of uncontrolled mixing characteristics, which may introduce uncertainties in both effective timing and effective pulses. The ability to quantify rate constants using hyperpolarized MR in the first seconds of consecutive enzyme activity is important for further development of the utilization of dynamic nuclear polarization-MR for biological determinations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».