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Enregistrement W1941481034 · doi:10.1111/imb.12004

Multiple ancient horizontal gene transfers and duplications in lepidopteran species

2012· article· en· W1941481034 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueInsect Molecular Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyHorizontal gene transferGeneGene duplicationEvolutionary biologyGeneticsPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eukaryotic horizontal gene transfer (HGT) events are increasingly being discovered yet few reports have summarized multiple occurrences in a wide range of species. We systematically investigated HGT events in the order Lepidoptera by employing a series of filters. Bombyx mori, Danaus plexippus and Heliconius melpomene had 13, 12 and 12 HGTs, respectively, from bacteria and fungi. These HGTs contributed a total of 64 predicted genes: 22 to B. mori, 22 to D. plexippus and 20 to H. melpomene. Several new genes were generated by post-transfer duplications. Post-transfer duplication of a suite of functional HGTs has rarely been reported in higher organisms. The distributional patterns of paralogues for certain genes differed in the three species, indicating potential independent duplication or loss events. All of these HGTs had homologues expressed in some other lepidopterans, indicating ancient transfer events. Most HGTs were involved in the metabolism of sugar and amino acids. These HGTs appeared to have experienced amelioration, purifying selection and accelerated evolution to adapt to the background genome of the recipient. The discovery of ancient, massive HGTs and duplications in lepidopterans and their adaptive evolution provides further insights into the evolutionary significance of the events from donors to multicellular host recipients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,142
Score d'incertitude au seuil0,823

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle